उचित प्रक्रिया के माध्यम से चुने गए नेट / गेट योग्य उम्मीदवारों को पीएचडी के लिए नामांकन करने की अनुमति दी जाएगी। कार्यक्रम और एनआईएफटीईएम क्रमशः पीएचडी के पहले, दूसरे और तीसरे वर्ष में "निफ्टम पीएचडी फैलोशिप" (16,000 / - रुपये, 18,000 / - रुपये, और 20,000 / - रुपये प्रति माह) प्रदान करेगा। । एनईटी / गेट के बिना उन लोगों को "निफ्ट पीएचडी छात्रवृत्ति" (12,000 / - प्रति माह) प्रदान की जाएगी।